シラバス参照

基本情報／Basic Information
詳細情報／Detailed Information
授業計画詳細情報／Class Schedule Details

基本情報/Basic Information

開講科目名／Course	生体生命情報学／Bioinformatics
時間割コード／Course Code	7222000127
ナンバリングコード／Numbering Code
開講所属／Course Offered by	理工学部／
曜日コマ／Day, Period	金／Fri　5
開講区分／Semester offered	後期／second semester
単位数／Credits	2.0
学年／Year	3,4
主担当教員／Main Instructor	種田晃人／TANEDA AKITO
科目区分／Course Group	専門教育科目　専門応用科目
教室／Classroom
必修・選択／Required/Elective	選択必修
授業形式／Class Format	講義科目
メディア授業／Media lecture	－

担当教員情報/Instructor Information

教員名／Instructor	教員所属名／Faculty/Department
種田晃人／TANEDA AKITO	理工学研究科／

難易度（レベル）／Level	レベル3
対応するＣＰ／ＤＰ／CP/DP	CP・DP　１　見通す力　　 CP・DP　２　解決していく力
授業としての具体的到達目標／Concrete arrival target as the class	生命情報をコンピュータ解析する際に利用されているアルゴリズムやデータの基礎について理解すること。また、それらのアルゴリズムやデータの利用法を理解すること。
授業の概要／Summary of the class	データ読み取り技術の向上、データベースに登録されているゲノム情報などの急激な増加に伴い生命情報の重要性が高まっています。本講義では、生命情報データを解析するための基礎的知識である生体分子の構造・機能や遺伝子について解説し、それらを入力データとするアルゴリズムについて講義を行います。
授業の内容予定／Contents plan of the class	以下の内容を１５回で行います。第１回ガイダンス第２回生体分子（DNA）の基礎第３回細胞分裂第４回転写第５回翻訳・これまでの小テスト第６回生体配列解析アルゴリズム（動的計画法）第７回生体配列解析アルゴリズム（様々なペアワイズ配列アライメント法）第８回生体配列解析アルゴリズム（多重配列アライメント）第９回生体配列解析アルゴリズム（ヒューリスティクス）第１０回動的計画法の演習第１１回生体配列解析に利用される機械学習（ニューラルネット）第１２回生体配列解析に利用される機械学習（誤差逆伝播法）第１３回発現データ解析とクラスタリング（階層的手法）第１４回発現データ解析とクラスタリング（非階層的手法）第１５回発現データ解析と主成分分析・小テスト中間・期末に小テストを行う予定です。
成績評価方法及び採点基準／A scholastic evaluation method and marking standard	講義中に課されるプログラミング等の課題（80%）、授業への参加度（20%）により評価されます。
予習及び復習等の内容／Contents such as preparations for lessons and the review	授業中に説明した分子生物学やアルゴリズムについて十分に復習すること。授業の内容予定に含まれている分子生物学や機械学習の話題について各自文献調査等をして予習しておくことが望ましい。
教材・教科書／The teaching materials, textbook	ガイダンスでアナウンスします。
参考文献／bibliography	講義中に指示します。
留意点・予備知識／Point to keep in mind, back ground	3年前期までのプログラミング・アルゴリズム関連の授業・演習・実験の内容を予備知識として持っていることを前提として授業を行います。
授業内容に関する質問・疑義等／Question, doubt about class contents	月曜１６：００～１７：００
Eメールアドレス・HPアドレス／E-mail address, HP address	taneda@eit.hirosaki-u.ac.jp
学問分野1（主学問分野）／Discipline 1	J60:情報科学、情報工学およびその関連分野
学問分野2（副学問分野）／Discipline 2	E37:生体分子化学およびその関連分野
学問分野3（副学問分野）／Discipline 3	該当なし
実務経験のある教員による授業科目について／About the class subject by the teacher with the work experience	なし
地域志向科目／Local intention subject	なし
授業形態・授業方法／Class form, class method	講義形式
科目ナンバー／The subject number
メディア授業による著作物利用の有無について／Whether or not copyrighted works are used in media classes	無／Nothing
その他／Others	特になし

No.	回（日時）／Time (date and time)	主題と位置付け（担当）／Subjects and instructor's position	学習方法と内容／Methods and contents	備考／Notes
該当するデータはありません

開講科目名／Course	生体生命情報学／Bioinformatics
時間割コード／Course Code	7222000127
ナンバリングコード／Numbering Code
開講所属／Course Offered by	理工学部／
曜日コマ／Day, Period	金／Fri　5
開講区分／Semester offered	後期／second semester
単位数／Credits	2.0
学年／Year	3,4
主担当教員／Main Instructor	種田晃人／TANEDA AKITO
科目区分／Course Group	専門教育科目　専門応用科目
教室／Classroom
必修・選択／Required/Elective	選択必修
授業形式／Class Format	講義科目
メディア授業／Media lecture	－

難易度（レベル）／Level	レベル3
対応するＣＰ／ＤＰ／CP/DP	CP・DP　１　見通す力　　 CP・DP　２　解決していく力
授業としての具体的到達目標／Concrete arrival target as the class	生命情報をコンピュータ解析する際に利用されているアルゴリズムやデータの基礎について理解すること。また、それらのアルゴリズムやデータの利用法を理解すること。
授業の概要／Summary of the class	データ読み取り技術の向上、データベースに登録されているゲノム情報などの急激な増加に伴い生命情報の重要性が高まっています。本講義では、生命情報データを解析するための基礎的知識である生体分子の構造・機能や遺伝子について解説し、それらを入力データとするアルゴリズムについて講義を行います。
授業の内容予定／Contents plan of the class	以下の内容を１５回で行います。第１回ガイダンス第２回生体分子（DNA）の基礎第３回細胞分裂第４回転写第５回翻訳・これまでの小テスト第６回生体配列解析アルゴリズム（動的計画法）第７回生体配列解析アルゴリズム（様々なペアワイズ配列アライメント法）第８回生体配列解析アルゴリズム（多重配列アライメント）第９回生体配列解析アルゴリズム（ヒューリスティクス）第１０回動的計画法の演習第１１回生体配列解析に利用される機械学習（ニューラルネット）第１２回生体配列解析に利用される機械学習（誤差逆伝播法）第１３回発現データ解析とクラスタリング（階層的手法）第１４回発現データ解析とクラスタリング（非階層的手法）第１５回発現データ解析と主成分分析・小テスト中間・期末に小テストを行う予定です。
成績評価方法及び採点基準／A scholastic evaluation method and marking standard	講義中に課されるプログラミング等の課題（80%）、授業への参加度（20%）により評価されます。
予習及び復習等の内容／Contents such as preparations for lessons and the review	授業中に説明した分子生物学やアルゴリズムについて十分に復習すること。授業の内容予定に含まれている分子生物学や機械学習の話題について各自文献調査等をして予習しておくことが望ましい。
教材・教科書／The teaching materials, textbook	ガイダンスでアナウンスします。
参考文献／bibliography	講義中に指示します。
留意点・予備知識／Point to keep in mind, back ground	3年前期までのプログラミング・アルゴリズム関連の授業・演習・実験の内容を予備知識として持っていることを前提として授業を行います。
授業内容に関する質問・疑義等／Question, doubt about class contents	月曜１６：００～１７：００
Eメールアドレス・HPアドレス／E-mail address, HP address	taneda@eit.hirosaki-u.ac.jp
学問分野1（主学問分野）／Discipline 1	J60:情報科学、情報工学およびその関連分野
学問分野2（副学問分野）／Discipline 2	E37:生体分子化学およびその関連分野
学問分野3（副学問分野）／Discipline 3	該当なし
実務経験のある教員による授業科目について／About the class subject by the teacher with the work experience	なし
地域志向科目／Local intention subject	なし
授業形態・授業方法／Class form, class method	講義形式
科目ナンバー／The subject number
メディア授業による著作物利用の有無について／Whether or not copyrighted works are used in media classes	無／Nothing
その他／Others	特になし

授業情報／Class Information

基本情報/Basic Information

担当教員情報/Instructor Information