基本情報/Basic Information

開講科目名 ／Course	コンピュータ分子設計学
時間割コード ／Course Code	8222000074
ターム・学期 ／Term・Semester	2022年度／Academic Year　　後期
曜日コマ ／Day, Period	金／Fri　3
開講区分 ／Semester offered	後期／second semester
単位数 ／Credits	2.0
主担当教員 ／Main Instructor	橋本 勝／HASHIMOTO MASARU
授業形式 ／Class Format

担当教員情報/Instructor Information

教員名 ／Instructor	教員所属名 ／Faculty/Department
橋本 勝／HASHIMOTO MASARU	農学生命科学部／

難易度（レベル） ／Level	レベル3
対応するＣＰ／ＤＰ ／CP/DP	CP・DP　１　見通す力　　    CP・DP　２　解決していく力
授業としての具体的到達目標 ／Concrete arrival target as the class	生理活性物質が生命現象を制御するメカニズムを官能基とその立体化学のレベルで理解する（見抜くことができる）. 分子モデリングの基本が理解できる（解ける）。
授業の概要 ／Summary of the class	Biologically active compounds such as toxins and drugs inhibit or stimulate some biological systems, that are important for the maintenance of the organism. In the first half of the course, students will learn the theory of molecular modelling, and in the second half, experience molecular calculations and modeling.
授業の内容予定 ／Contents plan of the class	1. Orientation 2. Why we use molecular modelling? 3. Review of chemical thermodynamics (1) Thermochemical reactions 4. Review of chemical thermodynamics (2) Standard enthalpies of formation etc. 5. Review of chemical thermodynamics (3) Thermodynamics of conformations 6. Stereochemistry and Computer Chemistry 7. History and current status of computer science 8. What computer chemistry tells us: Search of the most stable conformation 9. Calculation methods (molecular mechanics, semi-empirical molecular orbital method, ab initio molecular orbital method) 10. How to use the Spartan software 11. Finding the most stable conformation 12. Calculate charge distribution 13. Understand the reaction mechanism by computations. 14. How to use the protein data bank and visualization software 15. To visualize and analyze bioactive biomolecules
成績評価方法及び採点基準 ／A scholastic evaluation method and marking standard	Evaluation 1: (mini-reports after the class) 80% Evaluation 2: (Final report) 20%
予習及び復習等の内容 ／Contents such as preparations for lessons and the review	Students need prepare for the class according to the syllabus. Mini-report will be given for each lecture. Students need to review what they learned in the class.
教材・教科書 ／The teaching materials, textbook	not specified.
参考文献 ／bibliography	ヒーリー「SpartanModelによる有機化学演習」 ISBN978-4-902760-03-3 分子モデリング演習 初歩の初歩 ISBN4-902760-02-9 WEBページを開設しました。（http://molecules.a.la9.jp/modeling/index.html）講義内容とは一致しているわけではありません。
留意点・予備知識 ／Point to keep in mind, back ground	Common computer knowledge is required.
授業内容に関する質問・疑義等 ／Question, doubt about class contents	Monday 12:00-14:00
Eメールアドレス・HPアドレス ／E-mail address, HP address	e-mail:hmasaru[at]hirosaki-u.ac.jp home page URL: http://nature.cc.hirosaki-u.ac.jp/lab/2/biochem/yuki/ Please replace [at] into @
学問分野1（主学問分野） ／Discipline 1	E33:有機化学およびその関連分野
学問分野2（副学問分野） ／Discipline 2	F38:農芸化学およびその関連分野
学問分野3（副学問分野） ／Discipline 3	G43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
実務経験のある教員による授業科目について ／About the class subject by the teacher with the work experience	実務経験
地域志向科目 ／Local intention subject	なし
授業形態・授業方法 ／Class form, class method	The first half of the course is lecture-format and the second half is practical format.
科目ナンバー ／The subject number
メディア授業による著作物利用の有無について ／Whether or not copyrighted works are used in media classes	無／Nothing
その他 ／Others	Faculty with practical experience (researcher in an institute) will be in charge.

No.	回（日時） ／Time (date and time)	主題と位置付け（担当） ／Subjects and instructor's position	学習方法と内容 ／Methods and contents	備考 ／Notes
該当するデータはありません