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授業情報/Class Information

科目一覧へ戻る 2024/09/20 現在

基本情報/Basic Information

開講科目名
/Course
生物情報学実験実習
時間割コード
/Course Code
M241000047
ナンバリングコード
/Numbering Code
開講所属
/Course Offered by
医学研究科/
曜日コマ
/Day, Period
開講区分
/Semester offered
前期/first semester
単位数
/Credits
1.0
学年
/Year
2,3
主担当教員
/Main Instructor
玉田 嘉紀/TAMADA YOSHINORI
科目区分
/Course Group
大学院(博士課程) 
教室
/Classroom
必修・選択
/Required/Elective
授業形式
/Class Format
メディア授業
/Media lecture

担当教員情報/Instructor Information

教員名
/Instructor
教員所属名
/Faculty/Department
玉田 嘉紀/TAMADA YOSHINORI 医学研究科/
難易度(レベル)
/Level
レベル5
対応するDP
/DP
DP2
授業としての具体的到達目標
/Concrete arrival target as the class
情報科学、プログラミング技術、統計解析技術、機械学習技術を用いた生物情報グデータ解析の実験及び実習を通して生物情報学の問題解決ができる能力を獲得する。
授業の概要
/Summary of the class
実践的な生物情報学技術獲得のために、関連論文の抄読から始まり、トイデータ及びシミュレーションデータを用いた統計解析の実験と実習、及び機械学習モデルの実験と実習を行う。最後に実データを用いて発現データ解析、ゲノムデータ解析、その他生物情報学データ解析の実務を学ぶ。
授業の内容予定
/Contents plan of the class
第1回 論文抄読(1)
第2回 論文抄読(2)
第3回 論文抄読(3)
第4回 論文抄読(4)
第5回 論文抄読(5)
第6回 プログラミング実験(1)
第7回 プログラミング実験(2)
第8回 プログラミング実験(3)
第9回 プログラミング実験(4)
第10回 プログラミング実験(5)
第11回 プログラミング実習(1)
第12回 プログラミング実習(2)
第13回 プログラミング実習(3)
第14回 プログラミング実習(4)
第15回 プログラミング実習(5)
成績評価方法及び採点基準
/A scholastic evaluation method and marking standard
授業への参加度(60点)および口頭試問(40点)により評価する。
予習及び復習等の内容
/Contents such as preparations for lessons and the review
各回の講義項目に対し参考書などを用いて予習し、授業実施後に復習を行うこと。
教材・教科書
/The teaching materials, textbook
特に指定しない
参考文献
/bibliography
ヘネシー&パターソン コンピュータアーキテクチャ、翔泳社
T. コルメン、C. ライザーソン、R. リベスト アルゴリズムイントロダクション第1?3巻、近代科学社
八谷大岳 ゼロからつくるPython機械学習プログラミング入門、講談社
金明哲 Rによるデータサイエンス、森北出版
鈴木譲・植野真臣 編 確率的グラフィカルモデル、共立出版
留意点・予備知識
/Point to keep in mind, back ground
特になし
授業内容に関する質問・疑義等
/Question, doubt about class contents
金曜日17時~19時(要事前予約)
Eメールアドレス・HPアドレス
/E-mail address, HP address
玉田嘉紀( y.tamada@hirosaki-u.ac.jp )
https://ytlab.jp/mdi/
学問分野1(主学問分野)
/Discipline 1
J62:応用情報学およびその関連分野
学問分野2(副学問分野)
/Discipline 2
J60:情報科学、情報工学およびその関連分野
学問分野3(副学問分野)
/Discipline 3
J61:人間情報学およびその関連分野
地域志向科目
/Local intention subject
授業形態・授業方法
/Class form, class method
ゼミナール方式で、配布資料やスライドプレゼンテーション、あるいはテキストを使って講義をする。
科目ナンバー
/The subject number
メディア授業による著作物利用の有無について
/Whether or not copyrighted works are used in media classes
無/Nothing
その他
/Others
No. 回(日時)
/Time (date and time)
主題と位置付け(担当)
/Subjects and instructor's position
学習方法と内容
/Methods and contents
備考
/Notes
該当するデータはありません

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