シラバス参照

基本情報／Basic Information
詳細情報／Detailed Information
授業計画詳細情報／Class Schedule Details

基本情報/Basic Information

開講科目名／Course	生物情報学講義
時間割コード／Course Code	M242000317
ナンバリングコード／Numbering Code
開講所属／Course Offered by	医学研究科／
曜日コマ／Day, Period	他
開講区分／Semester offered	後期／second semester
単位数／Credits	2.0
学年／Year	1,2,3
主担当教員／Main Instructor	玉田　嘉紀／TAMADA YOSHINORI
科目区分／Course Group	大学院（博士課程）
教室／Classroom
必修・選択／Required/Elective
授業形式／Class Format	講義科目
メディア授業／Media lecture	－

担当教員情報/Instructor Information

教員名／Instructor	教員所属名／Faculty/Department
玉田　嘉紀／TAMADA YOSHINORI	医学研究科／

難易度（レベル）／Level	レベル5
対応するＤＰ／DP	DP2
授業としての具体的到達目標／Concrete arrival target as the class	本講義では現在の生物情報学分野の研究を俯瞰し、必要な情報科学、計算科学、統計科学の基礎知識を習得する。またプログラミングの基礎的な知識も獲得する。
授業の概要／Summary of the class	生物情報学は情報科学、計算機科学、統計科学などの情報学全般を駆使して生物学的な問題を解決しようとする学問分野である。本講義では現在の生物情報学を俯瞰し、必要な情報科学、計算科学、統計科学、機械学習を学ぶ。またプログラミングを習得するために Python および R を用いたプログラミングの座学を行う。専門的な内容としてグラフィカルモデルを紹介し、生物情報学分野の代表的課題である発現データ解析およびゲノムデータ解析について概要を紹介する。
授業の内容予定／Contents plan of the class	第１回 Python プログラミング（３）第２回 Python プログラミング（４）第３回 Python プログラミング（５）第４回 Python プログラミング（６）第５回 Python プログラミング（７）第６回 R プログラミング（１）第７回 R プログラミング（２）第８回 R プログラミング（３）第９回 R プログラミング（４）第１０回 R プログラミング（５）第１１回グラフィカルモデル（１）第１２回グラフィカルモデル（２）第１３回グラフィカルモデル（３）第１４回発現データ解析第１５回ゲノムデータ解析
成績評価方法及び採点基準／A scholastic evaluation method and marking standard	授業への参加度（６０点）および口頭試問（４０点）により評価する。
予習及び復習等の内容／Contents such as preparations for lessons and the review	各回の講義項目に対し参考書などを用いて予習し、授業実施後に復習を行うこと。
教材・教科書／The teaching materials, textbook	特に指定しない。
参考文献／bibliography	参考文献：ヘネシー＆パターソンコンピュータアーキテクチャ、翔泳社 T. コルメン、C. ライザーソン、R. リベストアルゴリズムイントロダクション第１?３巻、近代科学社八谷大岳ゼロからつくるPython機械学習プログラミング入門、講談社金明哲 Rによるデータサイエンス、森北出版鈴木譲・植野真臣編確率的グラフィカルモデル、共立出版
留意点・予備知識／Point to keep in mind, back ground	特になし
授業内容に関する質問・疑義等／Question, doubt about class contents	金曜日１７時～１９時（要事前予約）
Eメールアドレス・HPアドレス／E-mail address, HP address	玉田嘉紀（ y.tamada@hirosaki-u.ac.jp ） https://ytlab.jp/mdi/
学問分野1（主学問分野）／Discipline 1	J62:応用情報学およびその関連分野
学問分野2（副学問分野）／Discipline 2	J60:情報科学、情報工学およびその関連分野
学問分野3（副学問分野）／Discipline 3	J61:人間情報学およびその関連分野
地域志向科目／Local intention subject	なし
授業形態・授業方法／Class form, class method	ゼミナール方式で、配布資料やスライドプレゼンテーション、あるいはテキストを使って講義をする。
科目ナンバー／The subject number
メディア授業による著作物利用の有無について／Whether or not copyrighted works are used in media classes	無／Nothing
その他／Others

No.	回（日時）／Time (date and time)	主題と位置付け（担当）／Subjects and instructor's position	学習方法と内容／Methods and contents	備考／Notes
該当するデータはありません

開講科目名／Course	生物情報学講義
時間割コード／Course Code	M242000317
ナンバリングコード／Numbering Code
開講所属／Course Offered by	医学研究科／
曜日コマ／Day, Period	他
開講区分／Semester offered	後期／second semester
単位数／Credits	2.0
学年／Year	1,2,3
主担当教員／Main Instructor	玉田　嘉紀／TAMADA YOSHINORI
科目区分／Course Group	大学院（博士課程）
教室／Classroom
必修・選択／Required/Elective
授業形式／Class Format	講義科目
メディア授業／Media lecture	－

難易度（レベル）／Level	レベル5
対応するＤＰ／DP	DP2
授業としての具体的到達目標／Concrete arrival target as the class	本講義では現在の生物情報学分野の研究を俯瞰し、必要な情報科学、計算科学、統計科学の基礎知識を習得する。またプログラミングの基礎的な知識も獲得する。
授業の概要／Summary of the class	生物情報学は情報科学、計算機科学、統計科学などの情報学全般を駆使して生物学的な問題を解決しようとする学問分野である。本講義では現在の生物情報学を俯瞰し、必要な情報科学、計算科学、統計科学、機械学習を学ぶ。またプログラミングを習得するために Python および R を用いたプログラミングの座学を行う。専門的な内容としてグラフィカルモデルを紹介し、生物情報学分野の代表的課題である発現データ解析およびゲノムデータ解析について概要を紹介する。
授業の内容予定／Contents plan of the class	第１回 Python プログラミング（３）第２回 Python プログラミング（４）第３回 Python プログラミング（５）第４回 Python プログラミング（６）第５回 Python プログラミング（７）第６回 R プログラミング（１）第７回 R プログラミング（２）第８回 R プログラミング（３）第９回 R プログラミング（４）第１０回 R プログラミング（５）第１１回グラフィカルモデル（１）第１２回グラフィカルモデル（２）第１３回グラフィカルモデル（３）第１４回発現データ解析第１５回ゲノムデータ解析
成績評価方法及び採点基準／A scholastic evaluation method and marking standard	授業への参加度（６０点）および口頭試問（４０点）により評価する。
予習及び復習等の内容／Contents such as preparations for lessons and the review	各回の講義項目に対し参考書などを用いて予習し、授業実施後に復習を行うこと。
教材・教科書／The teaching materials, textbook	特に指定しない。
参考文献／bibliography	参考文献：ヘネシー＆パターソンコンピュータアーキテクチャ、翔泳社 T. コルメン、C. ライザーソン、R. リベストアルゴリズムイントロダクション第１?３巻、近代科学社八谷大岳ゼロからつくるPython機械学習プログラミング入門、講談社金明哲 Rによるデータサイエンス、森北出版鈴木譲・植野真臣編確率的グラフィカルモデル、共立出版
留意点・予備知識／Point to keep in mind, back ground	特になし
授業内容に関する質問・疑義等／Question, doubt about class contents	金曜日１７時～１９時（要事前予約）
Eメールアドレス・HPアドレス／E-mail address, HP address	玉田嘉紀（ y.tamada@hirosaki-u.ac.jp ） https://ytlab.jp/mdi/
学問分野1（主学問分野）／Discipline 1	J62:応用情報学およびその関連分野
学問分野2（副学問分野）／Discipline 2	J60:情報科学、情報工学およびその関連分野
学問分野3（副学問分野）／Discipline 3	J61:人間情報学およびその関連分野
地域志向科目／Local intention subject	なし
授業形態・授業方法／Class form, class method	ゼミナール方式で、配布資料やスライドプレゼンテーション、あるいはテキストを使って講義をする。
科目ナンバー／The subject number
メディア授業による著作物利用の有無について／Whether or not copyrighted works are used in media classes	無／Nothing
その他／Others

授業情報／Class Information

基本情報/Basic Information

担当教員情報/Instructor Information